Chaque projet dispose de son propre système de suivi & évaluation afin de pouvoir mesurer au mieux son avancement. Cependant, le programme a développé un système de suivi conjoint aux deux projets ASARA et AINA. Ce système est assuré par deux moyens :
- Un comité de pilotage conjoint qui se réunit semestriellement
- Un tableau d’indicateurs mesurant les résultats et réalisations consolidés
Concrètement, le suivi sur le terrain est assuré par une Unité de Suivi et de Coordination du Projet (USCP) pour ASARA et par des Comités Inter régionaux de Coordination (CIRC) piloté par la FAO pour le projet AINA.